东汉
法门寺始建于东汉末年桓灵年间 ，因舍利而置塔，木塔4层，塔下设有地宫，地宫中存放着用紫檀香木做成的棺椁，内以金瓶盛放佛祖指骨舍利。
北魏
法门寺供奉佛骨舍利的木塔在战火纷繁的十六国和南北朝混战时期屡遭破坏，特别是北魏太武帝拓跋焘采纳崔浩的建议，禁佛教，毁佛经、佛像和塔寺，致使该寺舍利塔在劫难逃，成为废墟。
隋代
隋文帝开皇三年（公元583年）改称“成实道场”，舍利塔随谓“成实道场合利塔”。仁寿二年（602年）右内史李敏二次开塔瞻礼。 隋义宁二年（公元618年），改“成实道场”为“法门寺”，塔也名为“法门寺舍利塔”。是年，法门寺不幸遭遇火焚，一片冲天火光后，仅剩塔基残垣。
唐代
唐太宗贞观五年（公元632年），岐州刺史张德亮在塔基上修筑望云殿，以殿代塔，殿楼4层。唐高宗显庆五年（公元660年）迎佛骨于东都洛阳，供养3年后，于龙朔二年（公元662年）送归法门寺地宫，并诏令和尚惠恭、意方等重修法门寺塔。
五代
后梁末帝龙德二年（公元922年），原唐节度使、岐王李茂贞修葺木塔，添置塔心樘柱，并在塔顶覆盖绿色琉璃瓦，每逢朝霞满天或夕阳西下时，塔顶金碧辉煌，塔身雄姿昂然，焕焕乎立于岐山之阳。
宋代
宋代法门寺承袭了唐代皇家寺院之宏阔气势，被恢复到最大规模，当时仅二十四院之一的“浴室院”即可日浴千人。宋徽宗曾手书“皇帝佛国”四字于山门之上。金元之际，法门寺仍是关中名刹，“藏经碑”中有寺僧抄写大藏经5000卷之记载。金人也刻“诗碑”盛赞其寺塔：“三级风檐压鲁地，九盘轮相壮秦川”。
明代
明清以后，法门寺逐渐衰落。明隆庆三年（公元1569年），凤翔府发生地震，历经数百年历史的唐代四级木塔崩塌。
清代
清顺治十一年（公元1654年），关中地区再次发生地震，法门寺塔身向西南方向歪斜，不少佛像从佛龛中跌落地面。清同治元年（公元1862年），法门寺因动乱一度被攻占，寺院也毁于大火之中。
